主要区别是，性质不同、位置不同、作用不同，具体如下：一、性质不同迷走神经迷走神经为混合神经。

2、副交感神经副交感神经所属植物神经系统（自主神经系统）的一部分。

二、位置不同迷走神经其运动纤维起自疑核，与舌咽神经并行，穿出脑干后经颈静脉孔出颅腔，供应除软腭肌和茎咽肌以外的所有咽、喉、软腭的肌肉。

感觉神经元在颈静脉孔附近的颈神经节和结神经节。

颈神经节的周围支传导一部分外耳道、鼓膜和耳廓的一般感觉，中枢支入三叉神经的脑干脊髓核。

结神经节的周围支传导咽、喉、气管、食管及各内脏的感觉，和咽、软腭、硬腭，会厌等部分的味觉，中枢支入弧束核。

2、副交感神经由脑干的某些核团及脊髓骶段的灰质中间外侧柱发出节前神经元，混合于脑神经（主要为面神经、舌咽神经及迷走神经）或脊神经中行走，到达器官内或器官旁，与副交感神经节中的节后神经元发生突触联系，随后节后神经元分布于内脏器官、平滑肌和腺体，并调节其功能活动。

三、作用不同迷走神经支配呼吸、消化两个系统。

2、副交感神经维持安静时的生理需要。

参考资料来源：百度百科-迷走神经参考资料来源：百度百科-副交感神经。