唐三杀死独孤博的原因是因为在给独孤博解毒的过程中，不小心导致了独孤博的死亡。唐三利用自己的解毒能力给独孤博解了大部分的毒，最后使用海神之力降下雨水试图包裹余毒，但最终导致独孤博因余毒被烧灭而死。两人之间原本是忘年之交，唐三并不会故意杀死他。这个事件是一个意外，并非唐三故意为之。

另外，唐三和独孤博之间确实有过矛盾，但后来两人成为了朋友。独孤博曾想要夺取唐三的宝物外附魂骨，但这是在他们成为朋友之后的事情。唐三并没有因为想要保护宝物而故意杀死独孤博，而是在帮助独孤博解毒时不慎造成了悲剧。

综上所述，唐三杀死独孤博是一个悲剧性的意外，而非出于故意。