南通机动车违章查询的方式有多种，包括：

1. 网站查询：南通市公安局交通巡逻警察支队车辆管理所官网提供了权威的违章查询服务。只需打开网页并输入相关信息（如车牌号码、车辆识别码等），即可查询到车辆的违章记录。

2. 手机APP查询：使用手机下载相关的交通违章查询APP，如“交管12123”等，输入车辆相关信息，即可查询违章记录。此外，这些APP通常还提供了罚款缴纳、车辆管理等多种功能。

3. 电话查询：可以拨打当地的交通管理部门的电话，查询机动车的违章信息。

4. 微信公众号查询：关注南通交警的官方微信公众号，在底部菜单点击“信息查询”，进入页面后点击“机动车违法”，然后输入车牌号码和车辆识别码进行查询。

5. 现场查询：携带有效证件（如身份证、驾驶证、行驶证等）到南通市的交警大队服务窗口现场查询车辆违章情况。

为确保信息的准确性，建议在多个平台进行查询，并将结果进行对比验证。处理违章时，请务必遵守相关法律法规，避免产生不必要的麻烦。