我正好也在写论文，遇到的问题和你的相似。

查了一些资料和问了同学，跟你说下。

首先，这个论文格式要看学校的，有的学校有自己的规定，最好先看看学校有没有相关的要求。

你的第一个问题：具体的脚注和尾注的定义我不说了，我们在论文里有需要注释和引用参考文献的地方，脚注可以用来做注释的，就是你觉得你的某一段话不加注释，影响别人的理解，位置在页脚；尾注在整个文档结尾可以用来编参考文献。

第二个：他们的格式，这个跟学校的要求是有关的。

脚注一般用带圆圈的数字，尾注一般是中括号带数字。

如［1］周振甫. 周易译注[M]. 北京：中华书局，1991.和② 碘量法(即Winkler法)测定水体中的溶解氧：（当页地脚注释：宋体小五号，对应文中序号圆圈的阿拉伯数字进行注释）第三个：参考文献里不需要书名号的，中括号里的英文字母表明了资料的来源，如著作是M，期刊是J，会议是C，报纸是N等等。

我是文科的，如果你是理科的话，应该还有专利P，数据库DB等等。

按我们学校硕士论文的要求，参考文献的末尾和人名后，一般是用英文的句号，如果是多个作者的话，中间用中文的逗号就行。

冒号一般用在出版社所在地址的前面，如北京：人民出版社。

最后，比较重要的是正文和标题的格式，都是不同的。

如果还有问题的话，我可以把我们学校的发给你参考。