在电视剧《斛珠夫人》的最后，主要角色的情感归属如下：

方诸和海市：他们两人虽然不能归隐，但能够相互守望，这被认为是他们最好的结局。方诸继续教导小皇帝，而海市作为摄政皇太后，能够施展她的才华，活得绚丽。

帝旭和缇兰：这两个角色虽然都死了，但他们的感情被描述为圆满。缇兰实现了她对帝旭的承诺，无论生死都陪伴在他身边。

卓英和柘榴：他们成为了整部剧中唯一有幸福结局的一对。卓英成为草原王后，柘榴成为了他的妻子，两人过上了幸福的生活。

方海市：她在剧中经历了许多波折，但最终活了下来，并且独自抚养了遗腹子，成为太后。

综上所述，方诸和海市最终没有在一起，而是各自以不同的方式继续生活和工作。卓英和柘榴则是一对幸福的夫妻。