根据提供的信息，禁止打安徽智飞第三针的原因主要有以下几点：

接种时间未到：有些市民在接种了安徽智飞的第二针后，发现第三针因缺货需要无限期等待，而这种情况可能是因为接种最后一针的间隔时间还未到。一般来说，第三针应在6个月内接种完，而第二针是在八周内，所以只要在11月上旬接种完都没事。

疫苗缺货：近期部分地区出现了不少境外输入病例，导致大家对接种新冠疫苗的重要性有了更深的认识。然而，由于新冠疫苗接种量巨大，导致了疫苗缺货的情况。这种情况一般不会耽误大家的最佳接种时间，因此只需要关注接种点的疫苗相关信息，有放安徽智飞疫苗时，立即去预约接种。

产能较低：相比国内其他新冠疫苗，安徽智飞疫苗的产能较低。其拥有1条原液线、4条制剂线和7条包装线，每分钟可以生产2000剂重组新冠疫苗，每天产量超过100万剂。若一切顺利的话，智飞2021年生产的重组新冠疫苗(CHO细胞)年产能达5亿剂。而北京科兴中维年产能将超过20亿剂，是目前国内供应最多的新冠疫苗，也是出口量和接种量最大的中国新冠疫苗。

优先接种第一剂次人群：近期我国多地地区出现了本土疫情，大家也意识到了接种新冠疫苗的重要性，而还有很多人都未接种过一针疫苗，因此这段时可能优先接种第一剂次人群。

以上就是禁止打安徽智飞第三针的主要原因。