有些专家提出，从污染源防止蓝藻的滋生，如控制或转移氮、磷等外源性营养盐以及有毒、有害污染物质的输入；调引清洁水冲洗，以稀释扩散营养盐的浓度等，不能直接排入下水道，必须经过氮磷去除型污水净化系统处理后再排放等等，这些都只能治标而不能治本，对于现在已经爆发的蓝藻水域，我觉得最好采用生物工程治理蓝藻，“以菌治菌，以物治物”，通过有益微生物的新陈代谢使有机物无机化，有毒物质无害化。

在处理蓝藻过程中，有益微生物将废水中含的污染物作为营养源，吞噬和分解废物、加速代谢，使有益菌迅速生长繁殖，在水体中快速占领优势生态位，抑制有害菌的生长繁殖，从而达到降解污染物、除臭、净化水体的作用。

微生物产品方面，我见过很多，但比较值得信赖的是三色源菌剂，含菌量高，稳定，效果明显。