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国5车和国6车的区别是：国6车采用了燃料中性的原则，即无论采用哪种燃料，排放限值都是相同的，而国5车在柴油机车型和汽油机车型的排放标准各不相同；国5车标准发布部门是环保部；国6标准发布机构是环境保护部和国家质检总局。

国6排放标准是目前国五排放标准的升级版，对一氧化碳、总碳氢化合物、非甲烷碳氢化合物、氮氧化物、颗粒物质量的排放限值相比国五标准有了更加严苛的限定，同时新增了对颗粒物数量的排放规定。